工業循環冷卻水系統在運行過程中，由于水分蒸發、風吹損失等情況使循環水不斷濃縮，其中所含的鹽類超標，陰陽離子增加、pH值明顯變化，致使水質惡化，而循環水的溫度，pH值和營養成分有利于微生物的繁殖，冷卻塔上充足的日光照射更是藻類生長的理想地方。而結垢控制及腐蝕控制、微生物的控制等等，必然的需要進行循環水處理。

藻類對循環冷卻水系統的危害主要有：

1、冷卻塔是藻類生長的理想環境，它們會在塔壁、水槽中、配水池里繁殖，通過碳的同化作用，借助陽光，使水中 的 CO2 和 HCO3 -進行光合作用，并吸收碳作營養而放出氧。藻 類的大量繁殖，會使水中溶解氧增加，腐蝕性也就隨著增大。

2、許多藻類在其細胞中產生具有惡臭的油類和環醇類，藻類死亡后成為污泥會產生臭味并使水變色。

3、冷卻塔的配水槽和噴嘴上也常因藻類繁殖堵塞孔口，影響配水的均勻性，使塔的冷卻效率下降。 塔壁上大片藻類脫落也可能造成系統堵塞。

4、硅藻由于其細胞壁上充滿著聚合的二氧化硅，將引起硅污垢。